p-value: | 1e-5 |
log p-value: | -1.159e+01 |
Information Content per bp: | 1.769 |
Number of Target Sequences with motif | 5.0 |
Percentage of Target Sequences with motif | 0.58% |
Number of Background Sequences with motif | 15.7 |
Percentage of Background Sequences with motif | 0.03% |
Average Position of motif in Targets | 68.9 +/- 19.8bp |
Average Position of motif in Background | 52.7 +/- 24.3bp |
Strand Bias (log2 ratio + to - strand density) | 0.3 |
Multiplicity (# of sites on avg that occur together) | 1.20 |
Motif File: | file (matrix) reverse opposite |
SVG Files for Logos: | forward logo reverse opposite |
PH0146.1_Pou3f1/Jaspar
Match Rank: | 1 |
Score: | 0.91 |
Offset: | -3 |
Orientation: | forward strand |
Alignment: | ---TAATTAATTAATT- AATTAATTAATTAATTC |
|
|
|
PH0149.1_Pou3f4/Jaspar
Match Rank: | 2 |
Score: | 0.89 |
Offset: | -3 |
Orientation: | forward strand |
Alignment: | ---TAATTAATTAATT- AATTAATTAATTAATTC |
|
|
|
PH0093.1_Lhx3/Jaspar
Match Rank: | 3 |
Score: | 0.87 |
Offset: | -2 |
Orientation: | reverse strand |
Alignment: | --TAATTAATTAATT-- NNTATTTAATTAATTNN |
|
|
|
PH0142.1_Pou1f1/Jaspar
Match Rank: | 4 |
Score: | 0.87 |
Offset: | -3 |
Orientation: | forward strand |
Alignment: | ---TAATTAATTAATT- GATTAATTAATTAAGTC |
|
|
|
Lhx3/MA0135.1/Jaspar
Match Rank: | 5 |
Score: | 0.85 |
Offset: | 0 |
Orientation: | forward strand |
Alignment: | TAATTAATTAATT AAATTAATTAATC |
|
|
|
PH0095.1_Lhx5/Jaspar
Match Rank: | 6 |
Score: | 0.85 |
Offset: | -2 |
Orientation: | reverse strand |
Alignment: | --TAATTAATTAATT-- ANNATTTAATTAATTNN |
|
|
|
PH0019.1_Dbx2/Jaspar
Match Rank: | 7 |
Score: | 0.83 |
Offset: | -2 |
Orientation: | forward strand |
Alignment: | --TAATTAATTAATT- TTTAATTAATTAATTC |
|
|
|
PH0101.1_Lmx1b/Jaspar
Match Rank: | 8 |
Score: | 0.83 |
Offset: | -2 |
Orientation: | forward strand |
Alignment: | --TAATTAATTAATT-- AGTTTTTAATTAATTTG |
|
|
|
PH0091.1_Lhx1/Jaspar
Match Rank: | 9 |
Score: | 0.83 |
Offset: | -2 |
Orientation: | reverse strand |
Alignment: | --TAATTAATTAATT-- NNTTATTAATTAATNCN |
|
|
|
PH0070.1_Hoxc5/Jaspar
Match Rank: | 10 |
Score: | 0.82 |
Offset: | -2 |
Orientation: | reverse strand |
Alignment: | --TAATTAATTAATT-- NNTNATTAATTAATTCG |
|
|
|